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通过这种假设我们不难发现，当时机械科学观给人们带来的困惑和矛盾，正如我们现在对爱因斯坦理论的感受。
中世纪的有机物理
我们在观察一个人的行为时，有时可以理解，有时又理解不了。
例如，如果我们只看到某人突然狂奔起来，会摸不着头脑，但是如果得知前面有人在撒钱时，则完全能够理解这个行为。
若一个人动机不明，他的行为则会难以捉摸。
动物亦然。
一只野兔在奔跑，可能是因为后面有条狗在追逐它。
任何运动的目的都是为了到达比初始点更有利的位置。
根据对象本质的不同，不同有机体的行为可以用不同的动机来解释，“有机科学”
也同样被用于解释非生命体的运动之中。
以下落的石头和升起的火焰为例，类比于善于挖洞的老鼠和在悬崖边筑巢的老鹰，石头本就应该在地球上，而火焰的位置在天空中某个绕地球旋转的球体上。
每个物体都有它最自然的状态，当这一状态被改变时，它的本能将会驱使其以最快的方式回到原来的状态中。
因此，当石头被抛向空中时，它将会尽快回到离地心最近的位置，如同被天敌追赶的老鼠在逃脱威胁后会立即回到自己的洞里。
当然，有时候石头并不会下落，这是由于一个“无法抗拒的力”
在对它起作用。
根据古代的哲学家的说法：“医生的天职是治疗，但是障碍可能使他无法实现这个目标。”
这是有机论中的一个最粗糙的推论。
当然，也有些运动显然没有任何目的性。
例如，天体的运动没有明确的目标，而是单纯重复同样的路径。
那么，人们认为天体被某个更高等的自然精神力量控制了，而维持永恒不变的运动正是这种精神力量的本能，就如同趋利避害是低等有机体的本能一样。
这种有机的观念以古希腊哲学家亚里士多德的思想为基础。
尽管这一观念本质上相当愚昧，但在中世纪时期这种类似的哲学观基础出现在很多哲学家的教义中。
这些哲学家包括被基督教教会奉为圣人并有“神学界之王”
之称的中世纪经院哲学的哲学家和神学家托马斯·阿奎纳（1225—1274）、犹太思想家和哲学家摩西·迈蒙尼德（1135—1204）以及伊斯兰的阿威洛依（1126—1198）。
物理和哲学
毫无疑问，伽利略是推进物理学由有机论转向机械论的关键人物。
他认为，哥白尼的日心说理论不仅仅是一时为了解释天文现象而做的假设，而是事实真相，揭示了真正的规律。
他胆敢质疑权威的中世纪物理体系根基。
伽利略首先从物体的匀速直线运动这一最简单的形式出发，接着考虑了具有恒定加速度的直线运动，即物体的速度在相等的时间内增加量相同。
接下来，基于这些简单运动形式的研究，他试图解释更复杂的运动。
伽利略发现所有的自由落体运动和抛物运动都具有一个共同点，即它们向下的加速度都是恒定的。
这类运动的速度可拆为两部分：保持大小和方向都不改变的初始速度（惯性运动），和垂直向下的加速度（重力作用）。
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